दो बार उत्परिवर्ती मकड़ियों की उपस्थिति को नष्ट करना और उनके प्रजनन को रोकना संभव था। लेकिन जाहिर तौर पर कुछ व्यक्ति छिपने में कामयाब रहे और वे हरे रंग की भूल-भुलैया में फिर से प्रकट हो गए। गेम स्पाइडर हंट 3 में आपको बमों का उपयोग करना होगा, अन्यथा आप मकड़ियों को नष्ट नहीं कर पाएंगे।