माइक्रो मेट्रॉइड में प्लेटफार्मों की दुनिया के माध्यम से अपनी यात्रा में सूक्ष्म नायक की मदद करें, जो विभिन्न बाधाओं के रूप में विभिन्न खतरों से भरा हुआ है। माइक्रो मेट्रॉइड में झंडे के रूप में चौकियों तक पहुंचने पर अपने चरित्र को तेज वस्तुओं से दूर ले जाएं जो उसे नुकसान पहुंचा सकती हैं।